Fajtłapowaty chłopak, nazywany Kudłatym, zaprzyjaźnia się z sympatycznym psem Scoobym-Doo. Wkrótce obaj, wraz ze sprytnym Fredem, inteligentną Velmą i piękną Daphne decydują się założyć agencję detektywistyczną - Tajemniczą Spółkę. Razem przeprowadzają setki śledztw i przeżywają mnóstwo przygód. Jednak pewnego dnia Scooby i jego przyjaciele stają w obliczu największego i najtrudniejszego wyzwania w karierze. Okazuje się, że pewien szaleniec zamierza uwolnić z zaświatów ducha psa Cerbera. Młodzi detektywi zdają sobie sprawę, że jeśli mu się to uda, na Ziemi zapanuje apokalipsa. Podczas gdy Tajemnicza Spółka robi co w jej mocy, by pokrzyżować plany szaleńca, przy okazji odkrywa sekrety z przeszłości Scooby'ego i poznaje jego przeznaczenie - wspanialsze, niż ktokolwiek z nich mógł sobie wyobrazić. Pierwsza kinowa animacja ze Scoobym-Doo w roli głównej.